Rumah Sakit Islam Pati memiliki fasilitas laboratorium yang dapat menunjang pemeriksaan serta membantu dokter memberikan diagnosis terhadap keluhan pasien. Laboratorium RSI Pati berperan memeriksa specimen darah, urin, feses, dan cairan tubuh untuk melakukan penapisan penyakit, penegakan diagnosis, dan pemantauan terapi. Pemeriksaan laboratorium memegang peran kunci dalam penegakan diagnosis penyakit dan penanganan penyakit tersebut.